安徽医科大学口腔医学院是安徽省培养口腔医学专业高级人才的重要基地。其建系于1984年，1997年9月建立附属口腔医院，2000年成立口腔医学院，2005年获批安徽省口腔医院。目前实行“三位一体”的管理体制，是安徽省唯一的省级三级口腔专科医院。
  安徽医科大学口腔医学院（医院）前身是上海东南医学院牙科，至今已有80多年历史。1984年获准招收口腔医学本科专业学生，2001年获口腔临床医学硕士学位授予权，2004年和中国科学院合肥物质科学研究院联合招收博士学位研究生，2006年开始对港澳台地区招收研究生，2008年口腔临床医学被遴选为省级重点学科，2008年被国家民政部和李嘉诚基金会批准为“重生行动—全国贫困家庭唇腭裂儿童手术康复计划”项目安徽省唯一项目承办单位，2008年我院口腔医学中心实验室被批准为省部共建实验室和安徽省口腔疾病研究省级实验室。2009年获得口腔医学专业学位授予权。